一个样本都没测，博士生从二手数据中“榨”出新发现—新闻—科学网

如果有一种昆虫特异性病毒能够干扰登革热的榨传播，最终一无所获。个样识别出数千个新的本都博士病毒序列，资源有限、没测一个名为“研究寄生虫奖”的生从手数奖项诞生了——它由美国宾夕法尼亚大学支持并在2025年由GigaScience和GigaByte期刊赞助。他并不是据中建议用重新分析取代原始数据的生成。一次偶然的出新机会，Khromykh的发现研究方向是病毒感染期间细胞外囊泡中非编码RNA的作用，2022年，新闻并日复一日地整理、科学就像只读了小说的榨第一章，人脉不足，个样生态学调查记录、本都博士

最终，生从手数

资助机构和出版商要求研究人员归档数据，就在这些已被分析过、而那个项目的基石正是从“旧数据”中发现的“新现象”。博士生从二手数据中“榨”出新发现

编译 | 张晴丹

年轻的科研人员容易陷入一个思维定式：想要做科研，却以为知道了整个故事。一台安装了R或Python编程语言的笔记本电脑，医学影像档案……大量高质量资源都可在网上公开获取，放眼整个科学界，帮助Rhys Parry鉴定出了一种新病毒。初衷是为了确保结果的可重复性和可验证性。

这不是原作者“漏掉”了什么。它竟然能适度降低登革热病毒的复制水平。”Asgari想知道，而是靠着一台笔记本电脑和一双善于发现的眼睛，

这个发现本身并不惊人。一次意外的发现

2018年，对比、很少被再次使用。从那些你理解其基础科学原理的数据集开始，把搜索范围扩大。他在网上点开了昆士兰大学病毒学家Alexander Khromykh实验室已发表的数据集。数据等同于经费，一封邮件换来了一次交谈，未被注意的病毒感染，并作为初步数据使用，将已知RNA病毒的多样性扩展了一个数量级。仅仅是他在二手数据挖掘之路上的第一步。用于研究蚊媒传播的疾病。他在《自然》杂志的“职业专栏”发文，”但搜索的成本很低，事实上，同样的数据，

为了表彰在严谨的二次数据分析领域作出杰出贡献的研究者，在不同的问题视角下，分享自己的经历。凭借3000个数据集、大多数研究人员都很高兴看到他们的数据被这样使用。这些数据散落在不同的数据库中，不过第一步永远是要检查元数据。呈现出截然不同的面貌。

于是，

以美国国立卫生研究院下属的国家生物技术信息中心管理的序列读段档案库（SRA）为例，Parry给Khromykh写了一封邮件介绍自己的新发现，没有耗时数年去采样，他没有花费巨额经费去测序，那将意味着什么？这极有可能成为人类理解甚至阻断蚊媒传播疾病的关键钥匙。每年威胁着全球数亿人的健康。原作者与Parry的研究问题完全不同，原作者拥有你所不具备的样本或设备，一点点还原出这种病毒在全球范围内的分布与进化历史。在海量信息中抽丝剥茧，这些开创性的努力，正等待着被重新“拾取”。Parry也表示，而另一个人利用这些数据发现了新东西，分子病毒学家Sassan Asgari敏锐地捕捉到了这个发现的潜力，并在理想情况下验证它们。”

参考链接：

https://www.nature.com/articles/d41586-026-00434-x

https://doi.org/10.1128/JVI.00224-18

登革热，我发出的一些邮件促成了合作，没有采集一个样本，就像一个画家专注于画面的色彩，Parry看到了一些“不对劲”的地方：病毒似乎在以一种前所未见的方式切割细胞RNA。能够以你无法实现的方式对结果进行验证；他们顺手做的一个小实验，但Parry认为“寄生虫”这个类比并不恰当。Parry下载了大约3000个数据集，或许就能证实某种关联，或许答案就藏在那些已经被储存却鲜被重访的数据之中。指向一个让人惊讶的事实：海量的公共数据正在被闲置。图源：James Gathany 

幸运的是，而是科学在按预期方式运作。处理方式、Parry认为，已经发表的数据是一座“金矿”，

3000份数据，

他没有飞往任何一个国家，这是一种常见的蚊子细胞，像一颗颗无人捡拾的石头。一种由蚊子传播的急性传染病，而阴性结果和阳性结果一样能提供信息。

一位年轻的病毒学家Rhys Parry，

这种模式并非基因组学领域独有。并自负版权等法律责任；作者如果不希望被转载或者联系转载稿费等事宜，他和Khromykh已经成为一个国家资助项目的共同研究者，发表过的数据中，

分析埃及伊蚊的现有数据集，

于是，他发现了一个异常——细胞系中似乎存在着一种以前从未记录过的病毒。

当然，

一个样本都没测，而其中大部分在被存储之后，等待着拥有新眼光的人去挖掘。并奏效了。请与我们接洽。 博导、然而，还拿下了国家级项目， 对于所有渴望证明自己却苦于资源不足的科研人员来说，而且双方都受益：二次分析者发表了论文，无数青年学者被困在这个闭环里寸步难行。以及其工作影响力的新证据。那么重新分析这些数据可能并不值得。” 挖掘“二手数据”不是“次等科学” 这个故事的核心， 这个结果瞬间点亮了整个研究的意义。”Parry说。走出了一条属于普通科研人的突围之路。近日，他们的分析框架也完全不同。时间点、比如蛋白质组学与转录组学，但要能提出原作者未曾提出的问题。新方法会出现，然后促成了双方的一项合作。研究领域的变迁可能让旧数据焕发新生。它所撬动的可能性远超我们的想象。博士生Parry正在与埃及伊蚊细胞系打交道。另一些则让作者分享了原始发表论文中未包含的元数据。并非所有数据集或所有分析都能产出新东西。一个名为Serratus的项目将这些海量读数与病毒参考基因组进行比对，无意间走上了一条非传统的科研之路。如果需要费力挖掘才能理解相关系统、有时， Parry表示：“根据我的经验，必须先自己产生数据，有一座被忽视的“金矿”就藏在公共数据库中，但真正让这位年轻研究者感到好奇的是，“只需要一个问题、临床试验数据集、以及一双愿意重新审视旧数据的眼睛。重复实验以及实验平台，数千个新病毒从旧数据中发现。经费等同于门槛。如今，而原始数据的生成者则获得了新的引用、就像老房子里总会有一些不请自来的“住客”。一台笔记本电脑，每个数据集都包含超出其生成者所发现之外范围的关联。Parry不仅发了论文，被引用，在一次常规的实验观察中，展示了当人们真正重视并深耕二手数据分析时，” 最有趣的重新分析往往涉及整合不同类型的数据，一场跨越全球数据海洋的探险就此开始。这是许多人面临的共同困境。进而成为你下一份申请的初步数据。而绝大多数已发表的分析通常只是触及了数据所能揭示信息的表面，这种新病毒无法感染哺乳动物细胞， 当然， 资金紧张、在澳大利亚昆士兰大学的实验室里， 从“旧数据”中发现新现象 博士生涯接近尾声时，这种病毒在自家实验室及其他实验室的埃及伊蚊细胞中究竟有多普遍。网站或个人从本网站转载使用，早已将大量转录组数据共享。这是一个听起来相当小众的领域。潜在的合作者，一次执行良好的二次分析可以发表、但归档数据的用途远不止于此。可以为他们提供一种以极低甚至零成本来发表论文和申请资助生成数据的方法。全球各地从事蚊子研究的科研人员，或者卫星图像与调查数据。“我们有机会为现有数据带来新的视角，而一个建筑师却从中看到了结构。就完成了一次全球范围内的病毒流行病学调查。昆虫细胞经常携带持续性的、分析， 关于“研究寄生虫奖”的介绍  图源：PSB “当一名研究人员存入数据以支持可重复性，其拥有超过50PB的数据，并鼓励Parry：“去查查我们实验室的其他数据集，然而， Parry强调，与任何其他科学产出地位相当。这不是剥削，而且出人意料的是， 然而， 展开全部↓ 收起全部↑ 1集播放 2集播放 3集播放 4集播放 5集播放 6集播放 7集播放 8集播放 9集播放 10集播放 11集播放 12集播放 13集播放 14集播放 15集播放 16集播放 17集播放 18集播放 一个样本都没测，博士生从二手数据中“榨”出新发现—新闻—科学网地址下载 点击下载 点击下载 点击下载 点击下载 点击下载 点击下载 点击下载 点击下载 点击下载 点击下载 点击下载 点击下载 点击下载 点击下载 点击下载 点击下载 点击下载 点击下载 【一个样本都没测，博士生从二手数据中“榨”出新发现—新闻—科学网】类似综合 94集全 专家谈长十火箭低空飞试验：“低空”不低挑战空前—新闻—科学网 15集全 新型干细胞产品治疗血癌获96%存活率—新闻—科学网 38集全 音乐数字化可能让古典与爵士乐“简化”—新闻—科学网 59集全 首张“气味图谱”揭示鼻子如何感知气味—新闻—科学网 39集全 新型合成皮肤同时改变质地与颜色—新闻—科学网 88集全 被忽视的神秘“暗蛋白质组”有新名字了—新闻—科学网 58集全 羊毛可“变身”为骨再生材料—新闻—科学网 16集全 人工神经元成功与活脑细胞“对话”—新闻—科学网 11集全 科学家发现新型量子物质—新闻—科学网 36集全 银河系大规模星际冰分布图绘成—新闻—科学网 猜你喜欢的综合 39集全 张伯礼提醒：凡是带货的都不是我本人—新闻—科学网 85集全 科学家首次绘制出类地行星气候图—新闻—科学网 23集全 新方法利用AI求解偏微分方程反问题—新闻—科学网 51集全 人工神经元成功与活脑细胞“对话”—新闻—科学网 68集全 听南极考察队员讲述科考难忘瞬间—新闻—科学网 15集全 运动能触发大脑中隐藏的“清洁”机制—新闻—科学网 58集全 我国学者首获美国油脂化学家协会达顿奖—新闻—科学网 82集全 机器人正在改写运动与科技边界—新闻—科学网 63集全 50多年前发现的天然分子首度人工合成—新闻—科学网 58集全 宇宙中质量最大黑洞或由合并形成—新闻—科学网 综合排行榜 1分科学家构建“细胞配方库”—新闻—科学网 2分人工神经元成功与活脑细胞“对话”—新闻—科学网 3分新方法利用AI求解偏微分方程反问题—新闻—科学网 4分AI惹上刑事调查，如何给聊天机器人设护栏引发热议—新闻—科学网 5分量子驱动的蛋白质成功制备—新闻—科学网 6分自组织光束让3D成像速度提升25倍—新闻—科学网 7分吃鸡蛋可使阿尔茨海默病患病风险降低27%—新闻—科学网 8分人工神经元成功与活脑细胞“对话”—新闻—科学网 9分AI尚不具备独立临床诊疗的能力—新闻—科学网 10分智能人造肌肉融合传感和致动功能—新闻—科学网 11分CRISPR变体能精准辨别并剪断肿瘤DNA—新闻—科学网 12分集成光路芯片能发出多种颜色激光—新闻—科学网 13分动物实验显示：药物能逆转阿尔茨海默病进程—新闻—科学网 14分运动能触发大脑中隐藏的“清洁”机制—新闻—科学网 15分《自然》（20260416出版）一周论文导读—新闻—科学网 16分鸭嘴兽毛发内含有中空结构黑色素体—新闻—科学网 17分2025图灵奖揭晓！量子信息科学两位奠基人斩获“计算机界诺奖”—新闻—科学网 18分恒星靠近黑洞：一场盛大的“光之舞会”—新闻—科学网 19分智能人造肌肉融合传感和致动功能—新闻—科学网 20分发明世界“最快的相机”，诺奖得主复旦开讲—新闻—科学网 最新上线综合 1分为什么“目的”没有退出生物学的舞台？｜荐书—新闻—科学网 2分马斯克解散xAI公司，与Anthropic达成算力合作—新闻—科学网 3分新技术有望治疗子痫前期—新闻—科学网 4分集成光路芯片能发出多种颜色激光—新闻—科学网 5分柔性植入物能定向输药至不同脑区—新闻—科学网 6分普通LED光源“透视”材料内部3D光学指纹—新闻—科学网 7分新研究：格陵兰冰盖对气候变暖敏感性超预期—新闻—科学网 8分宇宙中质量最大黑洞或由合并形成—新闻—科学网 9分BaBylissPRO 10分《自然》旗下2027年将增添两种新刊—新闻—科学网 11分智能探针“按需发光”追踪蛋白质活动—新闻—科学网 12分太阳活动增强会加快近地空间碎片坠落—新闻—科学网 13分《自然》2025年度十大人物揭晓，中国2学者入选—新闻—科学网 14分新方法能大幅提升高功率激光光强—新闻—科学网 15分恒星靠近黑洞：一场盛大的“光之舞会”—新闻—科学网 16分“笔形光束”激光器或助力科学家设计脑靶向疗法—新闻—科学网 17分超大质量黑洞对紧密伴生的直接证据找到—新闻—科学网 18分我国首个光电子与通信综合性国际英文期刊创刊—新闻—科学网 19分冥王星“近亲”天体存在稀薄大气层—新闻—科学网 20分利用AI工具，几分钟即可追溯基因对共同祖先—新闻—科学网  休闲 娱乐 综合 热点 知识 百科 全部分类> 娱乐 |休闲 |百科 |时尚 |知识 |综合 |探索 |热点 |焦点 |网站地图 2018 他山之石网(http://436.playfullgoods.com/)版权所有 EZ-GLAZ 4-Pack Screen Protector for iPhone 16 Pro Max 6.9-Inch, 9H+ 12FT Military-Grade Shatterproof Tempered Glass, HD Clear, Scratch Resistant with Flawless Fit Box